學術研究

儀器設備

服務項目與收費標準

蛋白質體學分析

服務項目 校內 校外
樣本水解(丙酮沉澱)與除鹽 800元
/樣本		 1,600元
/樣本
樣本水解(S-Trap)與除鹽 1,200元起/樣本 2,000元起/樣本
樣本除鹽 300元/樣本 600元/樣本
Dimethyl label 1,200元/樣本 1,200元/樣本
High pH Fractionation 1,600元起/樣本 1,600元起/樣本
SCX Fractionation 1,200元/樣本 1,200元/樣本
LC-MS/MS分析
(含蛋白質身份鑑定與資料庫比對)		 400元/小時 800元/小時


小分子分析
服務項目 校內 校外
LC-MS/MS分析 400元/樣本 800元/樣本

大量樣本之折扣
  1. 蛋白質身分鑑定與小分子分析，使用時間連續使用超過48小時以上者，收費將給予七折優惠。

合作研究計畫

1. 非本質譜儀實驗室表列之「服務項目」，以學術合作方式執行。
2. 學術合作之相關研究構想及方案，需經本院質譜儀實驗室管理委員會同意後，方可執行。
3. 其成果之分享等相關細節（如作者排序）則依一般學術合作慣例，由合作研究者自行擬定。原則於成果發表時，以本實驗室工作人員列名為共同作者。

送樣注意事項

  • 不接受放射性或具生物感染性樣品。
  • 送測樣品狀態：
  1. 固態粉末：建議為濃縮乾燥之樣品，並請註明總蛋白量，送測樣本至少需要1 μg以上。
  2. 溶液樣本：溶液樣品請註明溶劑成分、濃度與體積等資訊，避免置於含鹽類的溶液或界面活性劑（送測樣本至少需要3 pmol以上）。
  3. 膠體樣本：請先經過固定(fixation)處理，並置於含ddH2O的1.5 mL eppendorf內，且註明染色方式。建議附上膠體掃描圖，圖中註明取樣位置、估計分子量，以利分析前評估。
  • 樣品請先去除鹽類與界面活性劑；本實驗室亦提供樣本之除鹽服務，需另行收費，但無法去除界面活性劑，若因樣本除鹽不完全或是界面活性劑殘留，導致液相層析管柱阻塞者，需另外收取管柱更換費 (NTD.3,000)。
  • 小分子測定原則上使用Thermo Scientific TSQ Quantiva Triple Quadrupole串聯式質譜儀進行分析，使用者必須自行準備液相層析之移動相與分析管柱。

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研究成果

1.     Chen KC, Lin CM, Huang CJ, Chen SK, Wu ST, Chiang HS, Ku WC. Dual Roles of 17-β Estradiol in Estrogen Receptor-dependent Growth Inhibition in Renal Cell Carcinoma. Cancer Genomics Proteomics. 2016 May-Jun;13(3):219-30.
2.     Huang JH, Ku WC, Chen YC, Chang YL, Chu CY. Dual mechanisms regulate the nucleocytoplasmic localization of human DDX6. Sci Rep. 2017 Feb 20;7:42853.
3.     Lin YH, Ke CC, Wang YY, Chen MF, Chen TM, Ku WC, Chiang HS, Yeh CH. RAB10 Interacts with the Male Germ Cell-Specific GTPase-Activating Protein during Mammalian Spermiogenesis. Int J Mol Sci. 2017 Jan 5;18(1):97.
4.     Hsu WH, Shen YC, Shiao YJ, Kuo CH, Lu CK, Lin TY, Ku WC, Lin YL. Combined proteomic and metabolomic analyses of cerebrospinal fluid from mice with ischemic stroke reveals the effects of a Buyang Huanwu decoction in neurodegenerative disease. PLoS One. 2019 Jan 15;14(1):e0209184.
5.     Huang KT, Shen YL, Lee CN, Chu KY, Ku WC, Liu CY, Huang RS. Using Differential Threshold Effects of Individual and Combined Periconceptional Methyl Donor Status on Maternal Genomic LINE-1 and Imprinted H19 DNA Methylation to Predict Birth Weight Variance in the Taiwan Pregnancy-Newborn Epigenetics (TPNE) Cohort Study. J Nutr. 2020 Jan 1;150(1):108-117.
6.     Wang YY, Ke CC, Chen YL, Lin YH, Yu IS, Ku WC, O'Bryan MK, Lin YH. Deficiency of the Tbc1d21 gene causes male infertility with morphological abnormalities of the sperm mitochondria and flagellum in mice. PLoS Genet. 2020 Sep 25;16(9):e1009020.
7.     Cheng YC, Ku WC, Tseng TT, Wu CP, Li M, Lee SC. Anchorage independence altered vasculogenic phenotype of melanoma cells through downregulation in aminopeptidase N /syndecan-1/integrin β4 axis. Aging (Albany NY). 2020 Aug 4;12(17):16803-16819.
8.     Lin YH, Huang CY, Ke CC, Wang YY, Lai TH, Liu HC, Ku WC, Chan CC, Lin YH. ACTN4 Mediates SEPT14 Mutation-Induced Sperm Head Defects. Biomedicines. 2020 Nov 19;8(11):518.
9.     Ku WC, Chen SK, Lin CM, Tang C, and Wang YC. Label-free quantitative phosphoproteomics reveals the role of beta-estradiol in sunitinib-resistant renal cell carcinoma growth via perturbing transforming growing factor-beta pathway. Urological Science 30(3):p 107-113, May–Jun 2019.
10.  Ku WC, Sridharan B, Chen JY, Li JY, Yang SY, Lee MJ. Kaempferitrin-Treated HepG2 Differentially Expressed Exosomal Markers and Affect Extracellular Vesicle Sizes in the Secretome. Biomolecules. 2021 Jan 29;11(2):187.
11.  Chen SK, Wang YC, Lin TY, Wu HJ, Huang CJ, Ku WC. G-Protein-coupled Estrogen Receptor 1 Agonist G-1 Perturbs Sunitinib Resistance-related Phosphoproteomic Signatures in Renal Cell Carcinoma. Cancer Genomics Proteomics. 2021 May-Jun;18(3):207-220.
12.  Chen RL, Fang LH, Yang XY, El Amrani M, Uijtendaal EV, Chen YF, Ku WC. Therapeutic Drug Monitoring of Busulfan in Patients Undergoing Hematopoietic Cell Transplantation: A Pilot Single-Center Study in Taiwan. Pharmaceuticals (Basel). 2021 Jun 26;14(7):613.
13.  Lu ML, Ku WC, Syifa N, Hu SC, Chou CT, Wu YH, Kuo PH, Chen CH, Chen WJ, Wu TH. Developing a Sensitive Platform to Measure 5-Methyltetrahydrofolate in Subjects with MTHFR and PON1 Gene Polymorphisms. Nutrients. 2022 Aug 13;14(16):3320.
14.  Wang YY, Lin YH, Wu VC, Lin YH, Huang CY, Ku WC, Sun CY. Decreased Klotho Expression Causes Accelerated Decline of Male Fecundity through Oxidative Injury in Murine Testis. Antioxidants (Basel). 2023 Aug 25;12(9):1671.
15.  Pan PY, Ke CC, Wang YY, Lin YH, Ku WC, Au CF, Chan CC, Huang CY, Lin YH. Proteomic profiling of TBC1 domain family member 21-null sperms reveals the critical roles of TEKT 1 in their tail defects. Dev Dyn. 2024 Nov;253(11):1024-1035.
Ku WC, Liu CY, Huang CJ, Liao CC, Huang YC, Kong PH, Chen-Chan H, Tseng LM, Huang CC. Integrating functional proteomics and next generation sequencing reveals potential therapeutic targets for Taiwanese breast cancer. Clin Proteomics. 2025 Jan 22;22(1):4.

實驗室地點與聯繫方式

  • 地點：輔仁大學醫學院國璽樓MD312
  • 聯絡人：陳亭蓁 小姐
  • 電話：(02)2905-6724
  • 送樣時間：8:30-16:30 (週一至週五)
  • 使用者請於上班時間與技術員聯絡詢問儀器使用狀況。