基於輔仁大學全人教育之精神，培育符合國家社會需求且具備專業知識與人文素養之數學人才。

一、本系學士班應用數學組的教育目標是

引導學生了解數學的基本理論，訓練他們獨立思考、分析、推理、判斷與表達能力及創新意識；並激發其潛能，邁向多元發展。

二、本系學士班資訊數學組的教育目標是

培養具備數學基礎、數據分析能力以及資訊科技素養並能將數學概念及方法融入科技開發創新及應用之國際化人才。

三、本系碩士班的教育目標是

培養具備數學基本素養且能應用於資訊科技、數據分析、資訊數學以及數學教育師資等領域之人才。