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為了鼓勵醫學系學生與國際接軌，並且體驗其他國家的醫療制度、醫事行為、或是醫學相關研究，本系與多個姊妹校或是簽約學校有正式的學生交換或交流。學生們將可於各個學年度公告期限內準備相關資料，接受甄選後，有機會赴國外進行臨床選修課程、臨床見習課程、或是基礎醫學實驗研究等國際交流活動。
此外，我們也提供了與國外大學的共同課程，鼓勵學生於國外大學取得學位，為未來成為一位可參與基礎與臨床研究的醫學科學家做準備。
這些不同的交流與課程，將可培養醫學生的國際觀與接收不同的體驗，這是輔大醫學系的特色之一。目前正式執行中的學校與課程如下：
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